可能です。
複数の業者から借金をしていて個人版民事再生を申し立てる予定だが、その一部の業者について過払いが発生しそう、という場合は、裁判所に個人版民事再生の申立てを行う際に、過払い金が発生することを申告しておく必要があります。
なぜなら、取り戻した過払い金や、近い将来取り戻す予定の過払い金も、立派な財産だといえるからです。