会社から借入れをしていない限り、自己破産をした事実がわかってしまうことはありません。

自己破産手続きについては、すべての借金を裁判所に申告する必要があります。

そのため、会社から借入れをしている場合は、自己破産の手続き上債権者として扱われることとなりますので、会社に自己破産をしたことが判明してしまうことになります。

会社に秘密で借金を整理されたいということでしたら、任意整理を行うという選択肢があります。